Python#
Utilizar Python en TeideHPC#
Una vez conectados a los nodos de login, disponemos de una versión de Python por defecto, que es la versión 2.6.6. Para ver las versiones de Python disponibles, utilizamos la herramienta de modules:
module ava python
---------------------------------------------- /opt/envhpc/modulefiles/.rhel6 ----------------------------------------------
python/2.7.18/gcc python/3.5.4/gcc python/3.7.9/gcc python/3.8.11/gcc
Para cargar alguna de las versiones es posible que tengamos que cargar algún módulo previamente:
module load python/3.8.11/gcc
python/3.8.11/gcc(10):ERROR:151: Module 'python/3.8.11/gcc' depends on one of the module(s) 'openssl/1.1.1k/gcc'
python/3.8.11/gcc(10):ERROR:102: Tcl command execution failed: prereq openssl/1.1.1k/gcc
Por tanto, cargamos los módulos necesarios, en el orden correspondiente:
module load openssl/1.1.1k/gcc python/3.8.11/gcc
module list
Currently Loaded Modulefiles:
1) openssl/1.1.1k/gcc 2) python/3.8.11/gcc
Ahora podremos utilizar una versión específica de Python y utilizar entornos, donde instalar paquetes de Python de manera aislada.
Instalar paquetes de Python en /data#
Por defecto, Python instalará los paquetes en el /home del usuario. Este almacenamiento esta limitado en tamaño, así que deberíamos configurar los entornos e instalar el software en la partición de /data. Para hacer esto, tenemos que hacer lo siguiente:
Con la opción --target=DIR le indicamos a pip donde se tienen que instalar tanto el paquete solicitado, como todas sus dependencias. Por otro lado, la opción --install-option="--install-scripts=DIR, indica donde irán instalados los binarios, en caso de utilizar el paquete de python desde la línea de comandos directamente.
Luego, tenemos que añadir a nuestro PATH la nueva ruta para utilizar los binarios directamente:
Para hacerlo permanente, podemos añadir esa línea al final de nuestro ~/.bashrc.